מאגר רקמות אנושיות וניתוח רקמות

מאגר הרקמות האנושיות וניתוח רקמות משולב (HTR-TASR) ממומנים במשותף על ידי המרכז לסרטן והמחלקה לפתולוגיה. הם הוקמו על מנת להקל על מחקר התרגום של הפקולטה במרכז הסרטן, המחלקה לפתולוגיה, בית הספר לרפואה ובמוסדות שונים. אתר זה מתאר את השירותים המוצעים ופרטי יצירת הקשר של אנשי צוות HTR-TASR שיכולים לייעץ לגבי זמינות הדגימות וכל היבטי ההיסטולוגיה והפתולוגיה המולקולרית.

מטרה

כדי להקל על רכישה, אחסון והפצה של דגימות רקמה אנושית באיכות גבוהה לחוקרי UNM לשימוש בחקירות מדעיות תוך שמירה על עקרונות ותקנות אתיים, מדעיים וחקיקתיים מתאימים.

אנו משתמשים שיטות עבודה מומלצות של NCI למשאבי ביו-דגימות כמדריך שלנו.

על HTR- רקמות

המשאב המשותף של HTR-Tissue:

  • מועיל לחולים עתידיים בכך שהוא מאפשר לחוקרים גישה לרקמות שמורות ומתוחזקות שאולי לא היו זמינות אחרת
  • תועלת ל- UNM HSC על ידי חיזוק המשימה של מתן טיפול איכותי בחולים באמצעות טיפוח מחקר חדשני ובעל ערך קליני
  • פונקציית מתווך כנה של ה- HTR בהפצת דגימות שאינן מזוהות ללא 18 מזהים אישיים של HIPAA מגנה על החוקרים מפני סיבוכים / הפרות פוטנציאליים של HIPAA.

ה- TASR מספק מגוון של שירותי היסטולוגיה, כולל עיבוד והטבעת פרפין, פרפין וחיתוך קפוא, צביעת H&E, צביעת IHC, בניית TMA, דיגיטציה של שקפים וניתוח תמונה.

סיכום שירותי HTR-TASR ליישומי מענקים

למאגר הרקמות האנושיות וניתוח רקמות משותף (HTR-TASR) יכולת לבצע מספר טכניקות ומציע מגוון שירותים בתשלום עבור שירות שירות.

ה- HTR-TASR אוסף רקמות נורמליות וגידוליות תואמות בעיקר מדגימות כירורגיות שנותרו, ומאחסן אותן קפואות או כבלוקי פרפין קבועים בפורמלין (FFPE). החוקרים יכולים לבקש את הרקמות, עם האישורים הנדרשים מהמועצה לפיקוח על מחקרים אנושיים (IRB) והוועדה לפיקוח על רקמות (TROC, לשעבר SRC).

ה- HTR-TASR יכול גם לספק מספר היסטולוגיות ושירותים מולקולריים שונים, כגון חתך וצביעת H&E, אימונוהיסטוכימיה ואימונופלואורסצנטיות באמצעות פלטפורמת Ventana Discovery Ultra, יצירת מיקרו מערכים מותאמים אישית של רקמות (TMA), דיגיטציה של שקופיות (שדה פלואורסצנטי) באמצעות ה- Aperio Versa 200, וניתוח תמונות באמצעות פלטפורמת HALO ™ (ממעבדות Indica, המטה באלבוקרקי, נ.מ.).

ניתן להשיג סוגים שונים של עיבוד דם, כולל ביצוע ספירת תאים וכדאיות באמצעות Nexelom Cellometer 1000.

יש חוקרים שדורשים דגימות שהוכנו במיוחד או שיש להם דרישות דגימה ספציפיות. עבור מחקרים מאושרים אלה, אנשי HTR יאספו באופן פרוספקטיבי את הדגימות ותהליכים המותאמים לצרכי החוקרים. בנוסף, ישנם שירותים מולקולריים זמינים, כגון חילוץ DNA ו- RNA, PCR ו- PCR בזמן אמת. יש לקבוע פגישת כדאיות עם המנהל הטכני ומנהל התפעול כדי לדון בשירותים הרצויים.

כדי לאשר שימוש במשאב משותף זה, אנא כלול את הפרטים הבאים:

מחקר זה נתמך בחלקו על ידי מענם התמיכה של מרכז הסרטן המקיף של UNM, NCI P30CA118100, ועשה שימוש במאגר הרקמות האנושי ובניתוח רקמות משותף, המקבל תמיכה נוספת מבית הספר לרפואה של אוניברסיטת ניו מקסיקו לרפואה.

צרו קשר עם HTR-Tissue

טלפון: (505) 272-1127
דוא"ל: tissuebank@salud.unm.edu
חדרי פיץ הול 306B ו- 306C
בית הספר לרפואה של UNM HSC
המחלקה לפתולוגיה
MSC 08-4640
915 Camino de Salud, NE
אלבוקרקי, NM 87131

צוות HTR-TA

דניס מק'קנס, דוקטורטדניס ג'יי מקאנס דוקטורט

פרופסור למחקר, פתולוגיה

מנהל מדעי

מפקח על כל היבטי המשאב

אדגר פישר, MDאדגר פישר MD

פרופסור, פתולוגיה

מנהל רפואי

מפקח על היבטי בקרת האיכות של המשאב

קתלין מרטינז, פ.ד.הרשות הפלסטינית קתלין מרטינז

מנהל טכני

מפקח על ההיבטים הטכניים של המשאב

סיידי לה באוב, דוקטורטסיידי לה באוב דוקטורט

מומחה תפעולי

מנהל אחריות יומיומית

פרד שולץ, תואר שניפרד שולץ, תואר שני

ניהול אינפורמטיקה

שירותי היסטולוגיה ופתולוגיה מולקולרית

עיבוד רקמות והטמעת פרפין או הקפאת רקמה. הרקמה יכולה להיות מוכתמת בכתם H&E או להישאר ללא כתם.

המעבדה יכולה להכתים קטעי רקמות עם נוגדנים סטנדרטיים באמצעות פרוטוקולים שכבר קיימים. לחלופין, המעבדה יכולה לחשב נוגדנים באמצעות פלטפורמת VENTANA DISCOVERY המאפשרת שילובי צביעה מרובים כדי לייעל את תוצאות הצביעה.

תמונת HER-2 ו- ER
מכתים כפול עבור HER-2 ו- ER
מערכי רקמות HTR - e-cadherin

תכנון ובנייה של מערך מיקרו רקמות: זה כרוך באיסוף גושי פרפין תורם, בחירת אזורי העניין לליבה והצבת הליבות בבלוק פרפין מקבל ריק. היתרונות הם במהירות ובעלות, שכן ניתן להעריך מספר דגימות בשקופית אחת. ה- TMA האופייני מכיל כ -50 עד 200 ליבות בקוטר 0.6 מ"מ -2.0 מ"מ. ניתן להשיג כ- 50 מקטעים מגוש TMA אחד.

 

(מימין: E-cadherin)

אנשי HTR-TASR יכולים לאחזר גושי רקמות ארכיוניים מבית החולים UNM.

בדרך כלל זה כולל איסוף של רקמות עודפות או שרידים שנותרו בזמן כריתה כירורגית לאחר שנלקחו דגימות אבחון לבדיקה מיקרוסקופית של הפתולוג הכירורגי, ונשמרו מספיק דגימות בפרפין לצורך בדיקה עתידית אפשרית לטיפול בחולים. אנשי HTR-TASR יאספו את הרקמות בחדר הניתוח הגס של הפתולוגיה הכירורגית של UNM HSC. נכון לעכשיו, ה- HTR אינו מבצע ויניופונקטורה אלא יבנק דגימות כאלה כבקשת החוקרים.

יועצי פרויקט HTR-TASR יכולים לאסוף פתולוגיה ונתונים קליניים שמופשטים ממזהי HIPAA תוך קידוד לדגימות תואמות.

ניתוח תמונות

תמונות של H&E או קטעי רקמה מוכתמים באופן אימונוהיסטוכימי נלכדות בסורק הדיגיטלי Leica AT2 ומועלות לתוכנת ההדמיה והביאור HALO.

תוכנת HALO מאפשרת להוסיף הערות לרקמה (גידול, סטרומה, שריר, שומן וכו ') ואז לספור תאים החיוביים לחלבון לפי בחירה (איור, מימין) בכל אחד מהאזורים המבוארים. זה גם יאפשר לך לנתח ולכמת את האינטראקציות הקרובות בין השכנים.

התוכנה כוללת כלי לייצור דמויות שיכול ליצור תמונות מרובות פאנלים של תמונות בפורמטים הניתנים לפרסום כולל מסגרות הפניה וסרגל קנה מידה

תמונת תוצאות כמותית

איור זה מראה כימות של מכתים עבור Ki67 בסרטן השד. החלונית השמאלית העליונה מציגה את דגימת המיקרו מערך הרקמה, החלונית האמצעית מציגה מכתים Ki67 (חום) ללא הסימון HALO והלוח הימני מציג את אותה תמונה עם הסימון HALO.

הסימון מראה מכתים ברמה נמוכה (צהוב), מכתים בינוני (חום) ורמות גבוהות (אדומות) של Ki67 בגרעין תאי הגידול. מכתים כחולים הם תאים שליליים עבור Ki67. התוכנה יכולה לספור באופן עצמאי מכתים של Ki67 בסטומה של הגידול.

הטבלה מציגה קריאה של מספר ואחוז התאים בכל קטגוריית צביעה וההיסטוגרמה מראה את התפלגות הצביעה.

כיצד להגיש בקשה לדגימות

צרו קשר קתי מרטינז or סיידי לבוב לקבוע.

פתח את חשבונך ב- iLab:

  1. נווט אל דף הכניסה ל- iLabs.
  2. בפינה השמאלית העליונה של המסך, בחר הירשמו
  3. מלא את טופס ההרשמה בדף ההרשמה.
  4. קבל דוא"ל קבלת פנים מ- iLab עם אישורי כניסה והוראות

בקשת שירותים ב- iLab:

  1. קבע דרישת רכישה (יחסי ציבור) באמצעות המחלקה שלך. שלח את יחסי הציבור באימייל מרי שרמן מבקש להוסיף אותו תחת המעבדה שלך במערכת iLab.
  2. עבור אל כניסה ל- iLabs עמוד.
  3. בפינה השמאלית העליונה של דף זה, הזן את שם המשתמש והסיסמה שלך.
  4. בכרטיסייה "בקש שירותים" לחץ על "התחל בקשה" לצד שירות העניין (מאגר רקמות אנושיות לעומת שירותי פתולוגיה מולקולרית).
  5. מלא את הטופס וספק פרטי תשלום עבור בקשתך לפני הגשת הבקשה ל- HTR.
    1. וודא שכותרת הפרויקט ומספרי TROC / HRRC / IACUC תואמים לאלה המופיעים באותיות האישור שלך.
    2. תחת כל קטגוריית שירותים, הזן את המספר הרצוי ולחץ על הכרטיסייה "הוסף שירותים נבחרים". שירותים יתווספו בתחתית הטופס.
    3. השתמש בתיבה "מידע נוסף" כדי להוסיף פרטים חשובים, וצרף / העלה את כל המסמכים הרלוונטיים, כגון רשימת דגימות או תיאור כיוון.
  6. הבקשות ימתנו לבדיקה על ידי ה- HTR, אשר יבצע את כל השינויים הנדרשים ויגישו בחזרה לאישורך. תקבל אימייל מ- iLab בנוגע לבקשת הפרויקט המעודכנת שלך.
  1. הגש את הצעתך לוועדת פיקוח על רקמות (TROC). צור קשר עם קסנדרה מיסנר להדרכה בתהליך זה.
  2. לאחר ש- TROC מאשר את הצעתך, שלח את מכתב האישור עם בקשתך ל- UNM ועדת סקירה מוסדית של הוועדה למחקר אנושי (HRRC).

כדי לנווט בתהליך יישום ה- IRB:

  1. בקישור שלמעלה, לחץ על כפתור "לחץ על IRB" משמאל
  2. לחץ על הכרטיסייה IRB בחלק העליון של המסך
  3. לחץ על כפתור "צור מחקר חדש" משמאל
  4. למלא את הטופס
  5. בשאלה מס '7, לחץ על הקישור למעבר לספריה ובחר את הפרוטוקול המתאים למחקר שלך
    1. אם המחקר שלך דורש רק חומרים שאינם מזוהים בחר בפרוטוקול פטור מקטגוריה 4 (HRP-582). * הערה: יתכן שהרקמות המושלכות מזוהות אינן דורשות הסכמה
    2. אם המחקר שלך אינו דורש קבלת מידע על אנשים חיים, בחר מחקר לא אנושי (HRP-585)
    3. אתה רשאי להגיש להגשה מהירה אם המחקר שלך כולל רק דגימות שנאספו אך ורק למטרות שאינן מחקריות (כגון טיפול רפואי ואבחון).
  6. לאחר אישור HRRC, הגש בקשת רקמות ל- HTR באמצעות iLab. תעלה את מכתבי האישור שלך ל- SRC ו- IRB, ויש לך יחסי ציבור פעילים במערכת.
  1. צרו קשר עם ה- HTR-TASR לפגישת תכנון / כדאיות.
  2. הגש את הצעתך לוועדת פיקוח על רקמות (TROC). צור קשר עם קסנדרה מיסנר להדרכה בתהליך זה.
  3. לאחר שה- TROC אישר את הצעתך, שלח את מכתב האישור עם בקשתך לוועדת הביקורת המוסדית של ה- UNM (HRRC) (IRB) (ראה הוראות לעיל).
  4. פנה ל- HTR-TASR לפגישת תכנון נוספת (בדרך כלל נדרשת לבירור פרטי התהליך. פגישה זו כוללת קבלת אישור ממנהל המחלקה לפתולוגיה כירורגית בכדי להבטיח זמינות הדגימות תוך שמירה על ציות לתקנות המעבדה הלאומיות וטיפול מיטבי בחולים.
  5. אם נותרה לכם רקמה לאחר סגירת החקירה, עליכם להחזיר אותה ל- HTR
  1. עליכם לקבל אישור מהוועדה המקומית לבדיקת מחקר אנושי אם חלק כלשהו ברקמה שנאספה עשוי לשמש למחקר.
  2. ראש המחלקה לפתולוגיה כירורגית או ממונה עליהם לאשר את שיטת איסוף הדגימה בכדי להבטיח שמירה על רקמות ייצוגיות מספקות לטיפול קליני.

מלאי

אתר הרקמות שנאסף

(כולל רקמות ארכיוניות מ- UNM ואוסף פוטנציאלי לחוקרים למחקרים ספציפיים.)

  • שלפוחית ​​השתן, דם, עצם, מוח עצם, מוח, שד
  • קיר חזה, המעי הגס
  • סרעפת
  • כיס המרה
  • ראש וצוואר
  • כליות
  • כבד, ריאה, בלוטת לימפה
  • מדיאסטינום
  • Omentum, השחלה
  • לבלב, פין, צפק, ערמונית
  • רוק, בלוטת רוק, עור, מעי דק, רקמות רכות, טחול, בטן
  • אשך, תימוס, בלוטת התריס
  • רחם וצוואר הרחם
  • נרתיק / וולבה

רישום מורחב של סרטן השד (EBCR)

זהו אוסף רקמות מורכב המורכב ממעל ל -400 חולים שהוסכמו עם נקודות זמן מרובות וסוגי רקמה שנאספו. על כל מטופל נאספו הדברים הבאים:

  • 5 חלקי סרום מקסימליים / משתתפים / אוספים (כמו זמן בסיס או זמן FUP)
  • 10 חלקי פלזמה מקסימום / משתתף / אוסף
  • 10 נתחי DNA מדם מלא / משתתף / אוסף
  • 2 חלקי DNA מרביים ממי פה או ספוגית / משתתף / איסוף
  • רקמת שד (שאיבת מחט דקה, בקבוקונים ותבניות OCT) - כל המקרים שונים.

אנא צרו קשר עם HTR-TASR לשאילתה מפורטת יותר של מערך נתונים זה.